شفقنا – در پی درگذشت آقای سید جمال خویی فرزند آیت الله العظمی خویی، امام خمینی در ۱۱ تیر ۱۳۶۳/ ۲ شوال ۱۴۰۴ پیام تسلیتی برای این مرجع عالیقدر و زعیم حوزه علمیه نجف اشرف، صادر کرد.
با توجه به کوشش هایی که برای دامن زدن به اختلاف بین مقلدین این دو مرجع عالیقدر تشیع از سوی برخی محافل از جمله افراطیون یا افراد کم اطلاع یا بدخواهان صورت می گرفت، اهمیت این پیام در آن شرایط زمانی دو چندان می شود.
متن پیام به این شرح بود:
بسم الله الرحمن الرحیم
حضرت آیت الله خویی- دامت برکاته
با تاسف و تاثر مصیبت وارده بر جنابعالی و فامیل محترم را تسلیت عرض میکنم، و از خداوند تعالی برای آن مرحوم محترم «مغفرت»، و برای جنابعالی و بازماندگان او صبر جمیل و اجر جزیل مسالت مینمایم. و از خداوند تعالی عاجزانه میخواهم که دشمنان اسلام و دشمنان حوزههای مقدسه علمیه را به سزای خودشان برساند و در دنیا و آخرت آنان را رو سیاه فرماید، و مجد حوزه علمیه مبارکه نجف اشرف و سایر اعتاب مقدسه را با نابودی حزب عفلقی بعث عراق- خذلهم الله تعالی- به حال اول برگرداند و علمای اعلام و ملت شریف عراق را از چنگال صدام و صدامیان نجات مرحمت فرماید.
از جنابعالی و سایر علما و فضلای نجف و اهالی محترم عراق خواهانم که برای پیروزی لشکر اسلام بر فریب خوردگان لشکر کفر عفلقی در تحت قبّههای نورانی ائمه اطهار- علیهم السلام- خصوصاً سید الاولیا- علیه سلام الله- دعا فرمایند. و السلام علیکم و رحمه الله.
2 شوال المکرم 1404
روح الله الموسوی الخمینی